Covid-19 : une nonagénaire belge infectée par deux variants à la fois

Ce cas a été évoqué dans un rapport présenté récemment à l'European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (ECCMID) qui s'est tenu récemment en ligne.Le 3 mars 2021, une femme, dont les antécédents médicaux étaient sans particularité, a été admise à l'hôpital Onze-Lieve-Vrouwziekenhuis d'Alost après une série de chutes. La patiente de 90 ans, vivait seule et recevait des soins infirmiers à domicile, et n'avait pas été vaccinée. Le jour même de son arrivée à l'hôpital, elle a été testée positive à la Covid-19. Initialement, la nonagénaire présentait "un bon niveau de saturation en oxygène et pas de signaux de détresse respiratoire", selon l'ECCMID. Cependant, elle a développé des symptômes respiratoires qui se sont aggravé rapidement et elle a perdu la vie cinq jours plus tard.Lorsque l'échantillon respiratoire de la patiente a été testé sur place pour les COVs par PCR, les médecins ont constaté qu'elle avait été contaminée simultanément par deux souches différentes du virus - l'une originaire du Royaume-Uni, connue sous le nom de B.1.1.7 (Alpha), et une autre qui a été détecté pour la première fois en Afrique du Sud (B.1.351; Beta). La présence des deux souches a été confirmée par PCR sur un deuxième échantillon respiratoire, par séquençage du gène S et par séquençage du génome entier."Il s'agit du premier cas documenté de co-infection avec deux variants préoccupants du SARS-CoV-2," souligne l'auteure principal et biologiste moléculaire, le Dr Anne Vankeerberghen de l'hôpital OLVZ d'Alost. "Ces deux variants circulaient en Belgique à l'époque, et il est donc probable que la patiente ait été co-infectée par les virus de deux personnes différentes. Malheureusement, nous ne savons pas comment elle a été contaminée."La rapidité de la dégradation de son état de santé interroge les scientifiques. "Il est difficile de dire si la co-infection par deux variants préoccupants en est responsable," explique le Dr Vankeerberghen, qui juge crucial de davantage séquencer et étudier ce phénomène. "Jusqu'à présent, il n'y a eu aucun autre cas publié. Cependant, l'occurrence mondiale est probablement sous-estimée en raison du nombre limité de tests pour les variants préoccupants et de l'absence d'un moyen simple d'identifier les co-infections."Deux cas de personnes infectées par deux variants différents présents au Brésil ont été signalés en janvier 2021. Mais l'étude n'a pas encore été publiée dans une revue scientifique. De précédentes recherches ont également fait état de personnes infectées simultanément par différentes souches de grippe.(référence : EurekAlert, 10 juillet 2021)