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Une analyse rétrospective de patients atteints d'un cancer de l'oropharynx en récurrence de la maladie après un traitement initial (études 0129 et 0522 du Radiation Therapy Oncology Group- RTOG) montre que les patients HPV positifs ont un taux de survie globale plus élevé que les patients HPV-négatifs. A 2 ans après retraitement, la survie globale est de 54,6% pour les patients HPV-positifs vs 27,6% pour les patients HPV-négatifs. Les facteurs associés à un risque accru de décès comprennent un stade tumoral avancé au moment du diagnostic, moins de cycles de cisplatine et une récidive à distance vs une récurrente locale/régionale. Les patients HPV-positifs et HPV-négatifs ayant subi une chirurgie après récidive de leur cancer ont également une meilleure survie globale par rapport à ceux qui n'ont pas bénéficié de chirurgie, l'effet étant plus prononcé chez les patients HPV-positifs que chez les patients HPV-négatifs. Les récidives surviennent le plus souvent dans les poumons pour les deux groupes de patients.