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On rappellera que ce comité a pour mission de donner des avis sur le budget de fonctionnement et sur la gestion de l'AMPS. Les membres qui la composent représentent les secteurs qui financent l'APMPS (industrie pharmaceutique, pharmaciens, hôpitaux, grossistes, secteur des dispositifs médicaux, homéopathie, ...). Y siègent entre autres l'Administrateur général de l'AFMPS et le représentant de la Ministre de la Santé publique. L'AFMPS dispose d'un budget de fonctionnement annuel d'environ 70 millions d'euros.