Lorsque Wynen s'engage dans l'action syndicale, son but est clair et simple, ce qui en assurera la lisibilité tant pour les médecins que pour les médias : assurer l'indépendance et la liberté du médecin dans tous les aspects de la vie professionnelle. Son programme politique l'est tout autant : garantir les valeurs hippocratiques, le libre choix, la liberté thérapeutique, le dialogue singulier et le secret médical, les ingrédients de la qualité des soins et faire reconnaitre leurs prémisses : l'indépendance technique et morale du praticien indispensable pour assumer sa responsabilité vis-à-vis du patient, fut ce contre l'intérêt de la Société ou d'un gestionnaire.